Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms