Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms