Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms