Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms