Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms