Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms