Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms