Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms