Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp9bP98195 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms