Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Scn1bP97952 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scn1bP97952 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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