Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms