Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms