Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tarbp2P97473 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms