Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms