Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms