Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms