Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms