Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf5P70191 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms