Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms