Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga11P61622 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms