Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf13P61216 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf13P61216 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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