Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms