Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap25P60879 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap25P60879 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms