Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CirbpP60824 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms