Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rin3P59729 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rin3P59729 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rin3P59729 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms