Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms