Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdrg1P59048 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdrg1P59048 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms