Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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