Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms