Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms