Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms