Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Map3k1P53349 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms