Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ClgnP52194 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClgnP52194 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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