Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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