Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1swP51491 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1swP51491 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms