Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms