Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms