Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc3P49135 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms