Protein–RNA interactions for Protein: P47993

Xcl1, Lymphotactin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xcl1P47993 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Xcl1P47993 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms