Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms