Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms