Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LtbP41155 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LtbP41155 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LtbP41155 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms