Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms