Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chd1P40201 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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