Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc5P35689 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms