Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms