Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms