Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpardP35396 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpardP35396 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpardP35396 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpardP35396 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms