Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms