Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5cP35278 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms